Bei der Papierchromatographie wird Filterpapier als inerter Träger verwendet. Filterpapierfasern haben eine starke Affinität zu Wasser, das etwa 22% Wasser absorbieren kann, und 6-7% Wasser sind in Form einer Wasserstoffbindung an die Hydroxylgruppe von Cellulose gebunden, die unter allgemeinen Bedingungen schwer zu entfernen ist. Während die Affinität zwischen Filterpapierfaser und organischem Lösungsmittel sehr schwach ist, wird bei der allgemeinen Papierchromatographie das Bindungswasser der Filterpapierfaser als feste Phase und das organische Lösungsmittel als mobile Phase verwendet, wenn die mobile Phase vorliegt entlang des Papiers Beim Durchgang durch die Probe wird der gelöste Stoff am Probenpunkt kontinuierlich zwischen Wasser und organischer Phase verteilt. Ein Teil der Probe bewegt sich mit der mobilen Phase und tritt in die freie Zone des gelösten Stoffes ein. Zu diesem Zeitpunkt wird es neu verteilt und ein Teil des gelösten Stoffes tritt von der mobilen Phase in die stationäre Phase (Wasserphase) ein. Bei der kontinuierlichen Bewegung der mobilen Phase werden verschiedene Teile entsprechend ihren jeweiligen Verteilungskoeffizienten verteilt und bewegen sich entlang der mobilen Phase, so dass die Substanz abgetrennt und gereinigt werden kann.
Filterpapier ist eine Art Filterwerkzeug, das üblicherweise im chemischen Labor verwendet wird. Seine gemeinsame Form ist rund, meist aus Baumwollfaser.
